Si tienes toda la música en e iPhone y las apps es re fácil. Cuando vuelvas a instalar iTunes, conectas el iPhone y presionas el botón derecho de tu mouse sobre el ícono de iPhone y pones "transferir compras". Con eso pasarás las apps. Para la música utiliza iFunbox (gratis) y podrás sacar fotos, videos, películas, música, etc. O, en el caso de que uses mac, puedes usar Senuti para hacer el mismo proceso.
Salu2